1993年—2009年6月，石港镇疏浚河道160多条、总长324公里，修建桥梁200多座。1995—2000年结合创建卫生城市、新型小城镇，加快进行镇区拆迁改造。1997年，石港镇被评为省卫生镇。2003年被评为省新型示范小城镇。居民全部饮用长江水。2008年，自来水普及率96%、有线电视开通率81%、垃圾无害化处理率96%、改厕率78.3%、绿化覆盖率13%。境内公路总长52公里，基本实现水泥路到村、砂石路到组。

1993年起逐步调整学校布局和资源。1995年启动教育现代化工程。1997年，石港小学被评为省模范中心小学；1999年升格为省实验小学。石港镇被评为省实施教育现代化工程先进镇。2000年，石港初中进入省德育工作先进学校行列。2008年有中小学7所、在校学生8221人，幼儿园3所，成人中心校1所。

1993年起，石港镇各群众文化协会继续与如皋、盐城、扬州等地开展友好交流活动。1995年新建文化娱乐城。1997年，石港文化站被评为省特级文化站。1998年，石港镇被评为省体育示范乡镇。2002年，中央电视台专题报道石港镇群众文化工作情况。2005年出版发行《石港文史集萃》。2007年，石港镇建成首批省体育强镇。至2008年，石港镇被评为省群众文化先进集体2次、“中国民间艺术（京剧）之乡”2次、“中国民间文化艺术之乡”1次。

1995年，镇卫生院建成一级甲等医院，1996年与石港地区医院合并建石港中心医院。1998年，石港镇建成初级卫生保健合格镇。2008年，全镇有医院、卫生院3所，社区卫生服务站15个，妇幼保健所1个。初级卫生保健普及率100%、计划生育率99.7%。

1998年、2002年，石港镇先后被评为省科技先进镇、全国科普工作先进集体。2008年有省高新技术企业3个、南通市级工程研究中心2个。科技普及和技术改造方面投入4800多万元。全镇有各类专业技术人员4150人。

2006年，该镇开发建设石港渔湾风景区全长9公里，2007年被评为国家AA级旅游风景区，原生态的渔湾湿地吸引省内外游客观光旅游。2009年6月被上海旅游热线（联盟）命名为江海生态休闲旅游基地。