1993年，骑岸镇开始实施镇区改造、街道拓宽工程。1996年起，开展创建卫生镇工作，实施自来水工程。1996年、1999年先后被评为南通市卫生镇、省卫生镇。1998年实现村村通公路。2003年建成南通市有线电视达标镇。2004年，河道疏浚综合利用的经验在全省推广，镇村公路均为柏油或水泥路面。2005年，自来水普及率98%。2007年实施镇区亮化工程。2008年起，清洁水源、清洁田园、清洁家园的“三清”工程实行长效管理，绿化覆盖率20%。

1993年，由新华建筑公司捐建的骑岸小学“星源楼”落成。1996年起，实施教育现代化工程，2001年，骑岸镇被评为省教育现代化先进镇。2002年建成省成人教育示范基地。2004年，骑岸初中被评为省示范初中。2008年，全镇有中小学3所、在校学生1942人。

1996年、1999年，骑岸镇先后被评为省文化先进镇、省体育工作先进镇。2003—2005年连续3年被评为省全民健身活动先进镇。2004—2005年，5个家庭被评为省全民健身家庭。2006年，镇文化中心大楼建成，成为省首批乡镇文化标准化建设工程。2007年建成省首批体育强镇。至2009年6月，长篇叙事民歌《魏二郎》、民间舞蹈《荷花盘子舞》和《抬判》先后被列入南通市级和省级非物质文化遗产保护名录。

1998年，骑岸镇被评为省初级卫生保健合格镇。2001年被评为全国“婚育新风进万家”活动先进单位。2004年10月，骑岸卫生院被通州市中医院兼并。2006年3月，五总卫生院成为南通市中医院协作医院。2008年7月，骑岸镇应用省计生委与英国玛丽斯特普国际组织共同打造计划生育“世代服务”新品牌，在全市率先建成“世代服务”中心，拓宽计生服务领域。2008年，全镇有医院、卫生院2所，社区卫生服务站12个，卫生所1所。初级卫生保健普及率100%、计划生育率99.4%。

2003年推广水稻新品种，获省政府颁发的科技推广三等奖。2005年建成农村专业协会3个，基层党员干部科技素质培训基地2个。2006年—2009年6月，全镇有5200多名企业职工、1.46万农民接受科学技术培训，产生直接经济效益1000多万元。