20世纪90年代初，通州市（南通县）医疗专业机构设施设备简陋，乡镇医院一般只有100毫安以下的X线机，只能透视及拍摄四肢长骨片，化验室只有国产的显微镜，化验检查都是手工操作，只有少数乡镇医院有心电机和黑白B超。市级医院和中心医院一般配有200毫安以上X线机、B型超声诊断仪、半自动生化分析仪、血球计数仪等在当时较为先进的仪器设备。1995年，市人民医院、市中医院、市第三人民医院（通海中心医院）购进彩色脉冲多普勒超声诊断仪（彩超），同时市人民医院购进通州市首台X线电子计算机断层扫描装置（CT）及首台血液酸碱气体分析仪。1998年，市人民医院添置首台电子内窥镜。2001年，市第五人民医院购进呼吸机（无创），市级医院、中心医院和部分乡镇医院购置心电监护仪用于临床。2002年，市人民医院和市中医院，市第三、第四、第五、第六人民医院等单位购置500～750毫安医用X线诊断机。市人民医院首次购置人工肾透析装置。2003年，市人民医院购置移动X线诊断机。2004年，市人民医院、市第八人民医院购置呼吸机（有创）。海晏医院在乡镇医院中首次购置全自动生化分析仪。2005年，市人民医院购置首台800毫安以上医用X线诊断机，市第八人民医院购置高压氧仓。2006年，市人民医院首次购置危重病人监护系统。至2009年6月，市人民医院、市中医院及市第三、第六、第八人民医院普遍配置CT、彩超、500～800毫安X线机、全自动生化分析仪、电子内窥镜等医疗仪器设备；镇医院和专科医院，市第四、第五、第七人民医院普遍配置200～500毫安X光机、全自动（半自动）生化分析仪、B超、心电监护仪等，部分医疗单位配置彩超、呼吸机等。