1993年，全市有小学409所（含村小），教学班级2770个，在校生9.17万人，教职工4808人，适龄儿童入学率99.8%，巩固率99.6%，毕业年级学生毕业率100%，小学专任教师学历达标率71.45%，小学校舍建筑面积40.04万平方米，平均每班学生33.1人。此后随着各级政府加大对教育的投入和生源逐渐减少，学校布局调整的力度不断加大，大部分村小逐渐被撤并，办学条件进一步得到改善。到2009年6月底，全市有小学58所（含村小），教学班级1166个，在校生5.51万人，教职工3528人，适龄儿童入学率100%，年巩固率100%，毕业年级学生毕业率100%，小学专任教师学历达标率99.65%，生均校舍建筑面积6.5平方米，生均图书拥有量18.45册，平均每班学生47.23人。

1993年，各小学开展素质教育活动，狠抓“减负”工作。1994年专门组织检查组对全市小学进行“减负”专项检查，要求做好国家规定课程的开设工作，保证开齐开足所有课程。1999年开始，在省实验小学和骨干中心小学分别举办小学素质教育现场会，内容有观摩教学活动、参观学习现场学校的管理、图片展览、经验介绍等。2002年，制订小学素质教育综合考评制度，2004年进一步进行完善。市教育局每年对素质教育综合考评名次较好的小学进行表彰奖励。

1995年，全市推行每周40小时标准工作制，按国家教委调整的全日制中小学课程（教学）计划，在开展争创“江苏省实验小学”活动中，努力提升学校的办学档次和办学水平。1999年石港小学接受省实验小学验收，2000年川港小学升格为省实验小学，2002年实验小学、2003年金沙小学、2004年通州小学分别通过省实验小学的验收，2005年西亭小学、十总小学升格为省实验小学，2006年四安小学、刘桥小学升格为省实验小学。2007年省教育厅停止省实验小学的评审工作。至此，全市成功创建江苏省实验小学9所。

全市小学从2003年秋季入学的一年级新生开始进入新的一轮课程改革。推进课改的方式有：领导培训、教师培训，做到先培训后上岗，不培训不上岗；学科教学培训，理清教材思路，探究新课程教学方法；组织督查组到基层学校检查新课程开设情况和新课程标准执行情况；建立新课改辐射区，以省实验小学和骨干中心小学为龙头，带动周边一般小学开展课改；与小学素质教育现场会合并召开小学素质教育暨课程改革现场会，学习先进学校、先进地区的课改经验；编辑出版《课改通讯》，推助课改工作开展。