20世纪80年代初，按照国家科学技术进步奖励规定，南通县人民政府发布《南通县科学技术进步奖励规定》，同时设立南通县科学技术进步奖励评审委员会。1990年起，科学技术进步奖励委员会设在科委，每年组织专家对科技成果进行评审，经公示无异议后，由政府予以表彰奖励，同时推荐上报省和南通市级科技进步奖。1993年—2009年6月，通州市共获科技进步奖685项，其中省级以上27项，南通市级253项，通州市级410项。这些获奖项目涉及农业、工业、建筑业及社会事业等多个方面。

农  业  1993—2008年，列入记录的农业科技课题297项，已完成课题中获奖项目185项次。其中省部级奖14项，省厅地市级奖104项，县（市）级奖67项。“统供配方肥料技术研究与应用”获1995年省科技进步三等奖；“优质、高产中粳新品种‘通育粳1号’选育”获2005年南通市科技进步二等奖，通州市科技进步一等奖；“以防治口蹄疫为主的养猪综合配套技术”获1997年省农林厅丰收计划一等奖。

工  业  1993年—2009年6月，全市通过实施“科技兴企、技术创新工程”，建立健全以企业为中心的技术创新体系，有效推动高新技术和先进适用技术改造提升传统产业的进程。全市共开发市级以上新产品5000多只，其中省级近200只，国家级30多只。1997年，通州市乡镇企业广泛开展“一厂一品、科技兴企”活动，大力培植高新技术示范企业和高新技术主导产品，推动企业技术创新工作开展。江苏东源电器集团的ZZK系列智能化电器被国家计委确认为高新技术产业化推进项目。南通江海电容器有限公司片式高分子固体铝电解电容器产业化、风力发电及变频器用新型铝电解电容器产业化两个项目分别列入国家发改委2007年电子专用设备仪器、新型电子元器件及材料核心基础产业化专项和2008年省级现代服务业（软件产业）发展专项。

建筑业  1993年后，通州市建筑业坚持“科技兴建”战略，推广运用建设科技新成果。1993年，市建筑机械厂研制的QTZ25塔机，被国家科委评为新产品，南通四建“滑一浇一”新工艺获1994年国家专利。2006年起，全市建筑业把科技创新作为重点工作之一。2008年，南通四建经国家人力资源和社会保障部与全国博士后工作站批准设立博士后科研工作站，积极参与企业技术研究和项目攻关。同年，市基础工程有限公司成功引进旋挖钻孔新技术，该工艺代表当代钻孔灌注柱成孔技术先进水平。

教  育  1993年—2009年6月，全市教育系统有多项教育科研成果在国家、省和南通市获奖，其中影响较大的有：“小学青年教师培训研究”项目，2003年通过鉴定，并被国家教育部评为优秀教育科研成果二等奖。由市教科室承担的省教育科学“十五”规划重点课题——中小学教师可持续发展研究，其研究成果在鉴定中被高校专家称之为“填补了国内同类研究的空白”，并获省第二届教育科学优秀成果一等奖。

医药卫生  1993年—2009年6月，全市共有1300余篇医学论文发表在省级以上学术刊物，488篇论文参加省级以上学术会议交流，其中247篇论文参加全国性学术会议交流，42个项目获科技进步奖，其中省科技进步奖4项。优秀新技术引进奖14项，其中省厅医学新技术引进奖二等奖2项。市中医院院长季光主编的《现代治癌验方精选》正式出版后，被编入《临床经验精华》丛书。