20世纪90年代中后期，全市各乡镇相继配备科技助理。为提高其业务素质和工作能力，市科委多次举办乡镇科技助理培训班，学习《中华人民共和国科学技术进步法》《江苏省科学技术进步条例》及相关法律法规，还就科技项目源培育、科技项目申报、专利申报、农村科技示范园区培育与建设等方面进行业务培训。1997年—2009年6月，共举办培训班13期，参训400多人次。市科委在90年代末制定乡镇科技助理业绩考核办法，定期进行考核。

1993年—2009年6月，全市为农民和农村党员、干部举办各类实用技术培训班4500余期，参加培训人数达80余万人次，培训内容涉及农作物良种的推广，农作物病虫害防治，水稻抛秧、机插、散播技术，新品种蔬菜、水果引种管理技术，稻田养鱼、蟹、虾技术，海水养殖文蛤、青蛤、泥蚶技术，蟹苗人工繁育技术等。一大批农民和农村党员干部成为当地劳动致富的典型和带头人。石港镇成为科普教育基地。同时，通州市还进行农村富余劳动力就业前培训和农民经纪人培训，为农村富余劳动力输出、民营企业发展和农副产品加工、销售打下坚实基础。

1993年开始，市科委根据上级部门统一部署，结合职称评定，先后牵头在通州中学、通州职业中学、通州电大等单位举办计算机应用技术和外语应用能力的培训和等级考试。最初，计算机和外语等级考试每年举办两次，考前进行相应培训。1995年起在参考人员的要求下，科委根据设备、师资情况和管理水平，选定通州职业中学为计算机培训基地和常设考点，培训一批考一批，极大促进“双考”工作开展。1996年前，根据职改工作要求，市科委举办职称外语（主要是英语和日语）培训班10余期，培训3000余人次。1997年2月，通州市双考办在省双考工作总结表彰会上受表彰并作典型发言。1997年建立科技信息网后，市科委（科技局）创建自己的培训点，至2008年末，共举办公务员电子政务、网络技术等培训班55期，参加培训5632人次。