1992年，全县有各类专业技术人员2.24万人（从事自然学科工作的专业人员9000余人），经评定有专业技术职务任职资格的1.16万人。2008年末，全市专业技术人员增至7.77万人，有5.74万人评上技术职称，其中高级职称3215人，中级1.32万人，初级2.87万人；另有乡镇高级584人，中级2381人，初级9309人。有享受国务院颁发特殊津贴的专家8人，有突出贡献的省级中青年专家7人，南通市级中青年拔尖人才7人，通州市级中青年拔尖人才60人。

1993年—1996年5月，职称工作由市科委负责。工程、农业、教育、卫生、新闻出版等类别的职称须经过申报、评审、报批3个程序；经济类（经济、会计、统计等）的初、中级职称由全省统一进行考试确定，其中具备条件（本科学历、助理职称4年以上等）的可申报中级职称，而高级职称必须通过申报、评审和报批。通州市设有相应类别的中评委和初评委，申报材料由市职改办初审后转各有关评委会评审。通州市没有高评委，高级职称申报材料经相应类别中评委初审后向南通市高评委推荐，南通市高评委评审通过后报省批准。政工类职称由市委宣传部牵头，通过申报、评审进行。本科、大中专毕业生工作一年，见习期满可报经职改办直接认定为“助理”或“员”级职称。对于中高级职称的申报，申报者需通过全省统一的职称外语考试，1995年起对农业等类人员可免试外语。同时，根据经济建设需要和部分乡镇企业，特别是乡镇建筑企业要求，按照南通市统一部署，开展乡镇技术职称评审工作，评审标准按正常情况降一档（乡镇高级按中级标准，乡镇中级按助理标准），为建筑企业提高资质、在外地承包工程创造条件。

1996年5月，职称工作移交到市人事局，撤销原通州市职称改革领导小组及办公室，成立通州市职称工作领导小组，下设办公室，综合管理全市专业技术人员职称评审、职称晋升和职称考试工作。6月，根据南通市统一部署，调整各专业技术职称评审委员会。调整后设立3个中级职称评委会，即综合工程评委会（负责评审建设工程、机械工程、电子工程、化工工程、纺织工程5个中级专业技术职称）、中学一级教师评委会和小学高级教师评委会。设立8个初级职称评委会，分别负责建设工程、机电化工程、纺织工程、中学初级、小学中初级、农业技术、会计经济统计初级职称的评审工作。卫生系统初、中、高级都通过考试确定。高级职称的申报材料由市职称办初审后报送南通市职称办转相关高评委评审。1998年，分别成立通州市乡镇职称中级评委会和初级评委会，以建筑专业为主，评审高、中、初级乡镇专业技术职称。2006年，在全市农村开展农民专业技术职称认定。凡在乡镇、村组经济组织中从事农、林、牧、渔等工作的农民，均可参加农民技术职称的认定。认定的专业包括农业经营管理、农学、畜牧、兽医、林业、园艺、蚕桑、水产等。至2008年，全市共评出农民高级农艺师9人，农民农艺师1039人，农民助理农艺师3944人。2007年，新开设家纺设计专业职称评审。2008年，江苏金太阳纺织科技有限公司等单位的14人取得纺织品设计专业工程师任职资格。是年，通州市启动船舶工程职称评审试点工作，市人事局依照公开、公平、公正原则，制定切实可行的量化标准，严格审核申报材料，全年共评出船舶工程中级职称11人，初级职称21人。