1993年，国家开始推行公务员制度。1997年4月，通州市委、市政府召开动员大会，先后出台《通州市国家公务员制度实施方案》《通州市国家行政机关现有工作人员向国家公务员过渡实施意见》等文件，切实抓好全市机关人员过渡培训考试。除公安、财政、地税等人员多的部门实行单独培训外，其余的集中在市委党校分5期培训，全市机关和乡镇共有3835人参加过渡培训考试，平均成绩87.5分，合格率100%。凡考试合格者，都须进行资格审查。重点审查是否是国家干部身份、进机关审批的手续是否完备、是否机关在编在册在职人员以及是否具有政策规定暂缓过渡和不能过渡情况等。全市共批准过渡2328人，暂缓过渡43人，对过渡人员适时颁发国家公务员任命书。1998年6月顺利通过南通市组织的公务员制度入轨工作的检查、验收。

1996年全面实行机关工作人员录用公开招考制度，坚持“凡进必考”，面向社会，打破身份、地域限制，通过公开考试、考核、人员素质测评，择优录用，从源头上把好机关工作人员进门关。1999年实行省、市、县、乡四级联考。1996年—2009年6月，全市公开招考13次，报名参考人数5387人次，择优录用662名公务员（含公安院校分配286人和选录赴农村工作优秀大学毕业生46人）到各级机关工作。

2006年9月，市召开实施公务员法工作会议，全面部署公务员登记工作，下发《通州市公务员登记工作实施方案》，全市中国共产党各级机关、各级人大机关、行政机关、政协机关、审判机关、检察机关、人民团体、各民主党派和工商联机关中依法履行公职、纳入国家行政编制、由国家财政负担工资福利的人员，纳入公务员登记范围。全市予以登记1598人，暂缓登记41人，分开登记、单独统计38人。

1999年，市级机关推行竞争上岗，首先在市农业局、广电局、外经委等部门进行试点后全面推开。市法院、市检察院实施中层干部竞争上岗、一般干部双向选择的人事制度改革，受到省高院、省高检的充分肯定。2001年机构改革，市级机关中层及其以下职位全部竞争上岗，做到竞争范围、报名条件、竞争内容、操作程序、竞争职位、竞争过程、个人成绩、竞争结果八公开（《南通日报》对此经验作了报道）。全市39家单位282个职位纳入竞争序列，587人参与竞争。有62人因年龄原因退出中层职位，49人新任机关中层正职职位，54人新任中层副职职位，7人越级任职，103人得到提拔任用，同时有9名原中层干部在竞争中落选，被调整安排。中层干部平均年龄由45.5岁下降为36.5岁，大专以上文化程度由1993年的33%提高到2002年的67.5%。

2003年，出台《关于开展市级机关中层干部第二轮竞争上岗工作的意见》，从制定方案、审批方案、公布方案、报名确认、笔试、民主测评、面试（竞岗演讲）、组织考察、初定人选、任前公示、决定任命等环节予以进一步规范。通过竞争，有126人走上中层干部岗位，80多名中层干部进行轮岗交流，重点、热点岗位的交流率95%以上。全市中层干部平均年龄39.6岁，大专以上文化程度占90%。

2007年，首次开展跨部门竞争上岗。经单位申报、公开评议和组织决定，市委组织部、市人事局等15个部门的15个重点、热点中层职位实行跨部门公开竞争。全市范围内符合条件的373名国家公务员报考，91%的报考者参加笔试、面试。市抽调15名政治素质过硬的人员组成6个考察组，分别对入围的30人进行考察。对拟任职人选在全市范围内进行公示，广泛听取干部群众的意见。整个过程完全实行阳光操作。15名上岗人员平均年龄35.2岁，大学本科以上学历占93%，其中9人跨部门竞岗，6人原单位竞岗产生。这次跨部门竞岗的任职人员试用期为6个月。经考察合格，符合聘任条件的，由试用工作部门予以正式聘任，并列入市科（局）级后备干部管理，为此后在更广的领域选拔任用干部作出有益尝试。

推行公务员制度以后，通州市开展形式多样的培训工作。1997年，举办5期公务员过渡培训，3835人参加。2001年，完成全市所有公务员的世贸知识培训与考核工作。2003年，组织实施公务员计算机、外语培训和普通话培训测试工作，1296人取得计算机中级应用培训证书，970人通过外语初级培训考试，875人取得普通话三级甲等以上资格。2004年，开展行政许可法全员培训，并首次举行新录用公务员宣誓仪式。2005年开展公务员法培训和考试，全市3526人参加考试，参考率为99.6%，合格率100%。2006年实施“5+X”公务员能力培训工程（5指5门必修课，即公共服务、公共政策、公共经济、依法行政和创新能力知识，X指多种选修课），同时实行公务员培训学分制。2009年上半年开展《突发事件应对法》培训考核。通州被评为南通市“干部教育工作先进集体”。

1993年起，市纪委每年都要制定和完善加强机关作风建设的实施意见，并将作风建设纳入年终考核评先的重要内容。2000年，在全市国家公务员（机关工作人员）中开展学习“三个代表”重要思想和学习政治理论考试活动。2005年，制定颁布《通州市国家公务员行为规范实施细则》，要求公务员在服务行为中，不得重审批轻服务、以罚代管、越权行政、滥用权力；不得马虎懈怠、相互推诿、失职渎职和侵犯人民群众的利益；不得随意改变办事程序、增设申报事项、附加办事条件和延长办结时限；不得以情代法、徇私枉法；不得作风生硬、态度蛮横、行为粗暴、甚至故意刁难；不得违规操作、言行不一、对群众的批评和投诉置若罔闻，甚至打击报复；不得利用职权谋取私利，或者对当事人故意刁难；不得独断专行、揽权诿责、疏于管理、违法违纪。通过理论学习和规范行政服务行为，政府工作效率和公共服务水平明显提高，公务员作风建设取得良好成效，涌现出一批先进典型。1999年11月，市交通局局长施永新被省政府记一等功，通州经济开发区张友奎被评为南通市人民满意公务员，市科技局被评为南通市人民满意公务员集体。2006年，市地税局金云华、市发改委冯建军被评为南通市人民满意公务员，市财政局被评为南通市人民满意公务员集体。

1993年，通州市试行机关事业单位工作人员年度考核，当年参加考核的共有2.38万人，评定为优秀的3408人，称职的2.03万人，不称职的5人。1994年起，确定德、能、勤、绩、廉5项考核内容，重点考核工作实绩，考核对象扩大到事业单位全体人员。2001年起，考核等次增加基本称职（基本合格）等次。

2005年，为激励全市机关干部投身经济一线创业，专门出台《市级机关工作人员创业管理考核办法》。2006年，与上海元方计算机技术有限公司合作，开发目标管理绩效考评计算机软件。至2008年，全市已形成市级机关部门、镇区机关事业单位目标管理绩效考核等一整套较为完备的考核体系，逐步完善了以目标责任为载体，以绩效考核为核心，以激励约束为保障的运行机制，并运用计算机网络实现政府绩效全覆盖。2009年上半年，通州市“定性考评定标准，定量指标比高低”“宜工则工，宜农则农，宜商则商”“创设效能建设评估系数”的做法得到国家考核课题组的肯定，并作为经验录入《让人民满意》一书。《中国人事报》在《改革看点》栏目中作了介绍。