1993年，全市共有农村五保对象1550户1669人，其中集中供养878户948人，主要是老年、残疾、无劳动能力、无生活来源又无法定赡养、抚养、扶养义务人，或者其法定赡养、抚养、扶养义务人无赡养、抚养、扶养能力者（包括未满16周岁的孤儿）。五保供养金由市和镇（乡）两级财政按7∶3比例共同承担，集中供养和分散供养的标准分别为每人每年450元和400元。

1993—1996年，对农村五保户进行4次普查，共投入156.92万元，新建敬老院35所，帮助18所敬老院进行搬迁、扩建和改造。1995年，市民政局被南通市政府评为五保工作先进单位，观音山镇敬老院获“全国模范敬老院”称号。1996年，观音山镇自筹资金180万元完成敬老院建设工程；李港乡投资60万元在敬老院里新建“老人楼”。

1996年末，全市有五保对象1622户1721人，其中集中供养932户998人。供养标准分别提高到集中供养每人每年900元，分散供养每人每年850元。2000年，供养标准统一提高到每人每年1800元。

2004年，实施农村敬老院敬老爱老“十个一”（每个敬老院配有一部电话，新增一台彩电、一台洗衣机，健全一个活动室或阅览室，每个房间有一台电风扇，每位老人新增一条棉被、一套衣服、一个热水袋、做一次体检、过一个生日）工程，并且实现“应保尽保”，供养标准统一提高到每人每年2000元。

1997—2005年，全市共投入2500多万元，对四安、三余、新联、余北、金沙等15所乡镇敬老院进行新建、扩建和增添内部设施。2006年—2009年6月，先后投入5000多万元，实施农村敬老院“关爱工程”，对20个镇的敬老院进行新一轮改建、扩建和新建。同时，加强农村福利中心建设，以敬老院为依托，逐步实现农村社会福利事业由单纯供养型向福利服务型转变。

至2009年6月，全市20家敬老院共有床位2450张，集中供养五保对象1683人，供养标准为每人每年4200元。另有分散供养的五保对象688人，供养标准为每人每年3200元。