1996年起，市委、市政府把国防教育列入重要的社会系统工程，检查、督促各级党委、政府切实履行国防教育职责，协调和调动各方面的力量，形成对国防教育齐抓共管的局面。市人武部积极当好市委、市政府的参谋，每年将国防教育的要求、部署、具体实施意见，提请市领导结合中心工作统一安排，明确各部门的分工：宣传、文化部门着重宣传中央关于国防建设的方针、政策，介绍各地国防建设的成就和经验，营造加强国防建设的舆论；计划、经济、物资、财政等部门，对国防工程建设和后勤保障必需的物力、财力，随时做好动员准备；交通部门除实时提供公路、桥梁、车辆等国防动员资料外，主要是做好自身的交通战备应急的思想准备，特别是对每年度的新兵运输工作坚持精心组织，保证安全、准时，优质服务。1998年，新建的通州市革命烈士纪念碑落成，市领导、市直机关干部代表、共青团代表和金沙镇的干部群众代表共2000多人参加揭碑仪式。2005年，市烈士陵园管理处被南通市评为国防教育先进单位。

1997年，先后在《通州大众网》《通州大众》、通州人民广播电台开辟国防教育专题栏目，以宣传爱国主义为核心，强化国防观念。同时抓住每年春节的有利时机，对广大民兵、预备役人员开展职能教育和形势战备教育，并依托“青年民兵之家”“民兵活动中心”等阵地，抓好经常性的“强化战斗精神，提高打赢能力”教育，做好应急作战的充分思想准备，并组织民兵参加刊授国防知识竞赛、民兵工作条例知识竞赛活动。2001年3月，中国民兵杂志社组织的“玉溪杯”国防知识竞赛，市内先后有18万民兵和青年学生参加。

2003年，市政府把国防教育纳入全民教育体系、纳入党政干部的培训计划。市国动委政治动员办公室定期组织国防教育知识竞赛，文化部门在“八一”节前后组织放映军事题材影片。市军队离退休干部休养所还定期组织老同志为中小学生忆历史、讲传统，教育下一代牢固树立国防意识。

2007年初，市人武部对全民国防教育信息资源进行系统整合，创建全国首家永久性国防教育信息台，其发送的内容涉及国防、时事和民兵政治教育等。当年，市国动委带领所属机构（一综七办）人员参加南通市国动委组织的“通防—2007”演练，在为时7天的演习中，市国动委主要领导、国动委成员单位始终全程参与，圆满完成演练任务。