1993年起，相继在市内20多所中学，对2万多名中学生进行国防知识教育和军事训练。市人武部每年5月和8月分别对退伍军人和转业军官进行预备役登记。1996年8月，对全市1989年后退出现役转服军官预备役并经兵役机关登记的355名转业军官进行预备役军官军衔评定。

2000年6月，根据南通市政府、南通军分区关于组建预备役陆军步兵团的决定，通州市组建陆军步兵预备役团第一营。

2002年，预备役营着重抓了组织建设、战备训练和快速动员演练。在组织建设上，调整人员91人，其中复退军人占88%，人员在位率94%，参训率100%。在战备训练上，组织参加技能培训、预任干部集训和专业兵种集训，全年实训官兵328人，其中军官40人；同时抽调154人，动用各种武器150多支、车辆8台，参加预备役团为期4天的快速动员集合演练和阅兵、队列、射击等科目训练，都取得较好成绩。

2003年，预备役营以开展组建预备役部队20周年纪念活动为契机，修订战备方案，加强组织建设和军事训练，提高预备役部队的快速反应能力，调出7名、调入8名预任军官，提高队伍素质；组织新入队预任军官、士兵共40人进行基础集训和跨队联训，重点进行预备役知识、队列和战术基础、射击技能训练，开展参谋业务培训和“一日军营”活动，全营实训官兵310人，其中军官40人。同时，还组织部分炮兵专业兵赴安徽省三界参加军事演习。通州市预备役营被江苏预备役师评为2003年度“军事训练先进营”。

2004年，先后组织专业兵跨团联训及3个连队成建制快速动员集结演练。2005年，组织40多名预任干部去射阳参加全省高炮实弹射击，组织85名预任官兵参加南通市防空袭演练，组织50人在海门进行15天驻训，都圆满完成各项训练任务。

2006年起，市预备役营紧紧围绕提高应急作战能力，按照区域性、合理性、实用性、长远性和在作战时能迅速集结的要求，调整编制，设置连队，选配干部，提高预备役兵员的整体素质。2007年，市政府投入400多万元，建设预备役营车炮库，确保大型武器装备及时入库安全存放。2007年4—6月，市预备役营高炮连参加省军区组织的实弹射击演练，被评为先进连。