1993年后，通州市共驻守3支武装警察部队，即武警通州市边防大队（副团级建制）、武警通州市消防大队（正营级建制）和武警通州市中队（正连级建制），均受上级武警部队和地方党政机关双重领导，分别承担各自的军事训练和警务执勤任务。

武警通州市边防大队，又称通州市公安边防大队，下设新开港、遥望港、东灶港3个边防派出所，驻守海防前哨，负责沿海边防执勤和地方治安防范任务，并和当地民兵一起实行警民联防，开展反走私、反偷渡斗争和打击其他各类违法犯罪活动。

武警通州市消防大队，下辖1个消防中队，驻扎在通州市区新通掘路28号。全体官兵在日常进行灭火救援训练的同时，切实开展消防安全治理，加强消防监督执法，及时投入火灾扑救和其他抢险救援战斗，为社会经济发展和人民安居乐业作出了重要贡献。

武警通州市中队，常年驻守市看守所执行在押人员的看守勤务，同时协助地方进行民兵军事训练和处置突发性事件，开展警民共建活动，维护社会治安。

1993年—2009年6月，驻通州市的武警部队多次受到公安部和江苏省武警总队的表彰，分别被评为基层执法示范单位、执勤岗位练兵先进单位和警民共建先进集体。