1993年后，行政诉讼案件涉及领域不断扩大。市法院在行政案件审判工作中，坚持行政机关与公民诉讼地位平等原则，倡导行政机关负责人出庭应诉，促进依法行政，并注重依法保护公民的人身权利和其他合法权益。同时，加强对行政行为相对人的说服教育，加强协调沟通，促进干群关系改善，构建和谐环境。

1993年，在审理通州市袁灶乡铁岭村10名原告不服海门市公安局行政强制措施一案中，依法撤销被告海门市公安局1993年10月7日对原告许某等10人作出的限制人身自由的行政强制措施，判决海门市公安局一次性赔偿原告方的损失5000元。

1998年，在依法受理的非诉执行案件中，属房屋拆迁、城市监察、卫生防疫、交通规费等方面的案件占80%以上，因被执行人怀有对立情绪而影响执行。市法院在坚持对行政行为合法性审查的基础上，支持行政机关依法行政，维护公民、法人和其他组织的合法权益，组织人员、集中力量，依法开展专项执行：共执结125件，执行标的74.48万元。

2002年，为化解村级债务，市法院与市委农村工作办公室联合举办税费征收培训班，执结农业税和农民承担费用以及劳务欠款追缴案件324件，执结54.7万元。

2008年，调解成功行政诉讼案件32件，占全年审结行政诉讼案件的59.3%；受理非诉行政执行案件137件，经行政审判人员的说服教育后，均以行政行为相对人自觉履行的方式而结案。

1993年—2009年6月，市法院共受理各类行政诉讼案件789件，结案764件，结案率为96.8%。