1997年5—9月，市政法系统各部门对政法干警进行作风整顿，聘请行风监督员196人，先后发出征求意见信1240余封，走访351个单位，面对面征求意见1821人次；将收集来的意见，分类梳理成92条，逐条对照检查。针对存在的问题和出现的新情况，共修订制度15项，新制定制度32项，废除不适用制度4项。1998年3月下旬开始，在政法干警中开展“公正执法、文明执法”主题教育活动，组织先进事迹巡回演讲，用先进典型教育干警。并且召开各种座谈会，发出6000余份征求意见函，设立举报中心和举报电话，广泛接受社会各界监督。针对教育整顿中暴露出来的班子建设、干警录用、错案责任追究等方面的问题进行整改。按照中央关于政法机关不得经商办企业的规定，对相关单位所办的4个企业进行清理；对办结的1500余件案件逐一复查，查出其中处理有问题的50件案件及时给予纠正；查处干警违法违纪案件15件15人，清理“三乱”（乱收费、乱罚款、私设小金库）资金12.6万元。

1999年4月，根据省、南通市的统一部署，召开全市政法干警“争创人民满意政法单位、争当人民满意政法干警”活动动员大会，全面开展“双争”活动。6月，市公安局青年民警王建峰在执行公务时牺牲后，在全市政法干警中掀起学习王建峰事迹的热潮。当年经社会各界评议，评出10个人民满意政法单位、10名人民满意政法干警。

2003年起，开展政法队伍“业务大培训、岗位大练兵、技能大比武、素质大考核”活动，至2005年，先后举办各类岗位练兵217场次，有7754人次参加；开展各类比武竞赛73场次，有6440人次参加；组织素质考核119场次，有3919人次参加。同时建立理论学习、业务培训、素质考核、廉洁从警四大考评体系，推动政法队伍管理制度化、规范化、长效化建设。2003年，通州市公、检、法部门在南通市公、检、法系统组织的业务技能比武竞赛中，分别获得各自系统的团体总分第一名；16人受到省级以上表彰，67人受到南通市级表彰。

2005年，对涉法涉诉上访进行专项治理，市委政法委牵头办结越级上访的重大案件3件，办理上级机关或领导交办督办的案件9件。全年组织3次执法质量检查，重点评查发回案件24件，再审改判案件6件，确定差错案件6件，有关责任人都受到责任追究。针对案件协调和执法督查中暴露出来的薄弱环节，进一步完善案件协调程序，制订干警执法质量考评办法，规范执法行为，促进执法公正。

2008年，市委政法委出台《关于进一步加强督察工作的实施意见》和《督察责任追究暂行规定》，从人大代表、政协委员和社会各界中选聘59名能力强、威信高、懂法律的人员担任专职或兼职督察员。同时，适当吸纳社会团体、私营业主、普通群众加入督察行列，大力开展督察活动。全年共对政法部门的78个热点和重点岗位、窗口单位的作风问题进行集中督察，促使广大干警公正司法和规范执法。