1993年2月，南通县归侨侨眷联合会更名通州市归侨侨眷联合会。1993年起，市侨联贯彻执行全国侨联章程，发挥党和政府联系、团结归侨侨眷的桥梁与纽带作用，保护归侨侨眷的合法权利；教育他们遵守宪法和法律，维护社会主义法制，调动参加社会主义建设的积极性；鼓励、支持以各种形式加强与海外华侨、华人、港澳同胞及其社会团体的联系。至2009年6月，由侨界人士牵线促成的合资项目20多个。全市有归侨侨眷2710人，其中金沙镇1042人。

1993年，市侨联行政编制2个，设驻会主席1人。2003年制定《关于全面推进我市基层侨联工作的意见》，对基层侨联组织提出指导性意见。全市建立镇侨联小组18个，重点联系小组2个。2006年实施基层侨联小组建设达标工程，至2007年末，19个镇侨联工作达到“五有”（有组织、队伍、阵地、经费、活动）标准。至2009年6月，形成市有侨联组织、镇有侨联小组、村有侨联联络员的侨联工作互动网络；19个镇侨联小组均设立活动阵地“侨眷之家”，有联络员206人。

市归侨侨眷第三次代表大会  1994年12月21—22日召开，177名代表出席。会议主题：团结拼博，开拓进取，再谱侨联工作新篇章。会议选举产生市侨联委员会委员13人。三届一次全委会选举陈锦治为主席。

市归侨侨眷第四次代表大会  1999年11月29—30日召开，191名代表出席。会议主题：抓住新机遇，迎接新挑战，再谱侨联工作新篇章。会议选举产生市侨联委员会委员12人。四届一次全委会选举陈锦治为主席、赵莉玲为驻会副主席。

市归侨侨眷第五次代表大会  2004年12月27—28日召开，131名代表出席。会议主题：凝聚侨心，发挥侨力，为建设美好通州而努力奋斗。会议选举产生市侨联委员会委员16人。五届一次全委会选举许斌为主席、赵莉玲为驻会副主席。

宣传引导  1993年起，市侨联每年开展“下基层、进侨户”送法活动，通过学习、座谈、走访、联谊等形式，宣传贯彻《中华人民共和国归侨侨眷权益保护法》（以下简称《保护法》）。2003年开展“保护法”颁布10周年系列宣传活动，学习宣传新修订的《江苏省实施〈中华人民共和国归侨侨眷权益保护法〉办法》（以下简称《实施办法》）。2004年组织开展“六个一”（悬挂一条标语、发放一套资料、召开一次座谈会、办一件实事、走访一批归侨侨眷、搞好一次督察）侨法宣传月活动，以多种形式宣传贯彻《保护法》和《实施办法》。至2009年6月，共翻印侨务法规1.2万份，组织具有侨联特色的宣传教育活动100多次，发放宣传资料和慰问信7000多份。

1998年组织侨界名人事迹演讲。2000年起，组织小学生参加中国侨联组织的“世界华人小学生作文大赛”，至2005年，选送400多篇文章参赛，70篇获奖。2001年在归侨侨眷中开展纪念中国共产党建党80周年征文活动，有2篇文章被《江苏侨讯》刊用。2003年创办内刊《通州侨苑》，至2009年6月出刊7期，其中被省级刊物刊用11条，南通市刊物刊用26条。2006年开展“我为家乡发展建言献策”活动，收到建议意见40多条，其中侨眷张春华“将通州、海门两大家纺市场联合起来，组织中国家纺城”的建议获南通市侨界建言献策活动“金点子奖”，另有3人获优秀建议奖。2007年开展“创建侨界和谐家庭”主题活动，120户家庭被南通市侨联评为“和谐侨界家庭”。2008年组织“归侨侨眷和海外侨胞看改革开放三十周年”征文活动，加拿大华人赵振家的文章《祖国抚育我，我心系祖国——祖国强盛是亿万海内外华人华侨的共同心愿》获南通市征文一等奖。

招商引资  1993年起，市侨联结合全民创富、发展民营经济等重大活动，召开侨联委员座谈会、重点侨眷座谈会、招商引资促进会等，先后开展引资引智“五个一”（向海外亲友寄一封信、向侨联提供一条信息、引进一个项目、引荐一位客商、创办一个企业）活动以及爱国奉献建新功、热爱家乡见行动、招商引资作贡献、爱家乡创大业、侨界招商引资项目座谈会、侨界项目建设年汇报会等系列活动。至2009年6月，为市政府经贸洽谈会提供有经济实力的境外、海外人士翔实资料38份，联系和邀请客商150多人次；接待外商70多批。由侨界人士牵线促成的合资项目20多个，引进外资2000多万美元和人民币5000多万元。其中，侨眷刘斌积极向海外亲友宣传推介通州，2004年被评为全国归侨侨眷先进个人，至2008年，其亲友在通州创办企业4个。

联络联谊  1993年起，市侨联参与华人华侨联谊活动和引资、引智、文化交流与合作的牵线搭桥工作，通过召开迎春联谊会、中秋茶话会，走访慰问，组织参观，送发年画等形式，加强与归侨侨眷联系；通过邮寄贺卡、发电子邮件及电话拜年等形式，加强与海外侨胞联系。至2009年6月，市侨联接待探亲访友、经贸洽谈、扫墓祭祖的港澳同胞、华侨、华人等250批800多人次，其中接待来自美国、日本、英国等国家的华人华侨187批600多人次。1999年与科委、侨办共同组建通州市海外留学人员工作站。2004年起，开展“电邮传乡情”活动。2005年与加拿大江苏同乡会缔结友好社团，开展经济、文化、科技、教育等方面合作；组织以“重温战争、珍惜和平”为主题的中日文化交流活动，邀请抗日老战士讲述抗战史，带领日本朋友参观“纪念抗日战争胜利60周年书画展”。2006年组织中外学生联谊活动；承办南通地区首届侨界乒乓球赛。2008年与上海虹口区侨联、昆山市侨联缔结为友好侨联，开展协作活动。

为侨服务  1993年起，市侨联每年开展“送温暖进侨界”活动，在中秋、春节期间慰问探望归侨和部分重点侨眷。协同政府有关部门认真处理归侨、侨眷和海外侨胞来信来访，维护其合法权益，为侨排忧解难。1994年按《保护法》有关条款，为一位30年工龄的归侨解决补发退休工资差额部分；1995年为一侨眷解决房屋拆迁方面矛盾。2002年调查了解二甲、姜灶等镇侨资企业情况，为侨企做好服务工作。2003年，2名贫困侨眷享受到低保待遇。2004年1月起，4位困难归侨获得每月60～100元不等的定补。是年，市侨联与市中医院合作成立华侨医疗保健中心，为侨眷开辟医疗保健绿色通道。2005年组织“便侨利侨、真诚服务”义诊咨询活动；建立侨资企业跟踪服务工作机制，定期或不定期地深入侨资企业，排忧解难。2006年开展归侨回国50周年纪念活动，把困难归侨的定补统一提高到每月120元。2007年与公、检、法建立涉侨案件向侨联通报制度。2008年开展“亲情在侨联”活动，组织归侨体检、为归侨侨眷过70岁（含）以上整生日，先后为困难归侨筹措资金5000元。每次灾后，市侨联第一时间深入侨界，鼓励侨界群众和侨企开展自救，最大限度减少受灾损失。1993年—2009年6月，市侨联处理来信来访250件（人次）。其中，解决和处理在升学、就业、拆迁、建房、投资等方面困难和纠纷146项；为侨属企业妥善解决土地纠纷、税收等方面问题28项。

参政议政  1993年—2009年6月，全市有19名侨眷当选市人大代表和政协委员。侨界代表、委员们积极建言献策，先后提出合理化议案、提案及建议60多条，内容涉及经济、金融、交通、教育、医疗等方面社会热点和难点。有8件侨界提案被评为优秀提案，其中侨界政协委员蒋忠提出的关于转变机关干部作风的提案被市委、市政府采纳。