市政协委员由民主党派、无党派民主人士、各人民团体、各个界别协商提名推荐，中共通州市委有关部门对推荐名单进行综合平衡，并同各推荐单位协商，形成建议名单提交市政协常务委员会进行协商，经政协常务委员会委员过半数同意通过后确认。第八至第十一届政协委员任期均为5年。

八届政协工作小组  市政协八届一次会议后，根据政协委员分布比较分散实际情况，按地区在有关乡镇建立20个政协学习工作组，分别是金沙、西亭、二甲、三余、十总、骑岸、二窎、张芝山、川港、姜灶、小海、石港、五总、四安、刘桥、英雄、平潮、兴仁、观音山、正场学习工作组，共吸收八届政协委员111名。

九届政协联络组  市政协九届一次会议后，设立10个政协联络组，其中乡镇9个联络组，分别为金沙（下设金沙小组、西亭小组）、二甲、三余、十总（下设十总小组、骑岸小组、二窎小组）、石港（下设石港小组、四安小组）、刘桥、平潮、兴仁（下设兴仁小组、观音山小组、正场小组）、张芝山（下设张芝山小组、川港小组、姜灶小组、小海小组）联络组；市直政协联络组1个（下设党群口、统战口、宣传口、政法口、农水口、计经委口、建委口、财贸口8个小组）。2002年根据乡镇区划变化情况，全市政协联络组调整为27个。

十届政协联络组  2003年，市政协十届一次会议后，将全市300名政协委员划分为33个联络组，其中23个镇分别设立联络组，市直机关设10个联络组，分别为党群口、统战口、宣传口综合、宣传口教育、宣传口卫生、政法口、农水口、计经委口、建委口、财贸口联络组。

十一届政协联络组  2007年，市政协十一届一次会议后，将全市305名政协委员划分为31个联络组，其中在20个镇分别设立联络组，增设政协开发区联络组，市直机关设10个联络组，分别为党群口、统战口、宣传口综合、宣传口教育、宣传口卫生、政法口、农水口、发改委口、建委口、财贸口联络组。2008年初，川港镇和姜灶镇撤并后，成立川姜镇联络组。全市政协联络组为30个。