1993年1月，撤销南通县设立通州市。2月，中共南通县委员会改称中共通州市委员会。通州市党代会和市委的届次沿用南通县党代会和县委的届次序列。至2009年6月，通州市共召开3次党代表大会。每次代表大会分别由市委书记代表上届市委作工作报告，市纪委书记作纪律检查委员会工作报告，选举产生新一届市委委员和候补委员，选举产生新一届市纪委委员。