农业税  1993年，通州市纳税面积8.56万公顷，应征税额1702.7万元。1994年起，由于粮食收购价提高，农业税计税价格也相应提高，主粮计税单价每百公斤83元，农业税额调整为2164.1万元。2004年，农业税税率由上年7%调减为4%；农业税附加也相应降低。每亩征收农业税及附加由上年72.07元调减为41.18元。1993—2004年，全市共征收农业税4.47亿元。2005年按国家规定，实行农村税费改革，取消农业税征收。

农业特产税  1993年，全市征收130万元，占任务的166.7%。农业特产税收入全部留给地方，实行市、镇五五分成。通州市农业特产税税源主要是水产养殖、蚕桑和部分瓜果等，其中鳗鱼苗占相当大一部分。农民在农业税计税土地上生产农业特产产品，农业税照征，计算征收农业特产税时，采取差额征收办法将农业税扣除。2001年起，农业税计税面积上的农业特产产品免收农业特产税。1993—2002年，通州市共征收农业特产税1863.7万元。2003年按国家规定，停征农业特产税。

耕地占用税  1993年，继续对占用耕地建房或从事非农业建设的单位和个人，按批准实际占用耕地面积计征耕地占用税。平均税率为每平方米7.5元，农民建房占地减半征收。耕地占用税县乡分成40%（县25%、乡镇15%）作为农发基金收入，用于开垦宜耕土地及整理、改良耕地。1999年10月1日起实行预征办法。申请用地单位和个人在报送用地申请的同时，向当地财政部门预交耕地占用税，待审批用地后按实际占用面积结算，多退少补。2008年1月1日调整耕地占用税适用税额，占用耕地税额为30元/平方米，占用基本农田的适用税额提高50%。1993年—2009年6月，全市累计征收耕地占用税1.43亿元。

契  税  1993年—1997年9月30日，契税征收执行的是1950年4月3日中央人民政府政务院发布的《契税暂行条例》，1997年10月1日以后执行的是国务院颁布的《中华人民共和国契税暂行条例》，税源主要是商品房契税和土地出让转让契税，由市财政局农财农税科负责征收管理。契税税率为：买契税（含土地），按买价征收6%，1997年10月1日起省规定税率为4%，1999年8月1日个人购买自用普通住宅暂减半征收契税即2%（不含土地）；赠与契税，按现值价格征收4%；2009年1月份开始，单套住房面积在144平方米以下的税率由2%调整为1%，面积在144平方米以上的税率由4%调整为3%。契税收入全部留给地方，纳入地方预算管理。1993年契税收入25万元。2007年由于中国国际家纺城开发建设，当年契税收入猛增至1.16亿元。2009年为应对金融危机，通州市采取降低税率、财政补贴等积极的财政政策拉动内需，全市房地产市场疲软状况得到有效遏止，1—6月征收契税6686万元。1993年—2009年6月，全市累计征收契税4.65亿元。

农业发展基金  农业发展基金由市财政局（农发办）负责征收、财务核算和资金拨付及资金使用监督。1993年—2009年6月，全市共计征收农发基金2.92亿元，其中，防洪保安资金8019.83万元、土地收益金6963.07万元、生猪技改费440.66万元、农田建设统筹1254.44万元、建农资金467.85万元、江海堤防达标资金6178.85万元、农业重点开发建设资金1922.88万元、农村改水经费1025.92万元。根据国家、省减轻农民负担政策规定，部分项目征收标准逐年降低直至取消，主要有江海堤防达标资金、农田建设统筹、农村改水经费。

农业综合开发项目资金  1994年，通州市成为国家农业综合开发项目县，此后组织实施国家第三期至第七期（1994—2008年）农业综合开发项目，并组织实施国家秸秆养畜（羊）和省级垦区配套项目，总投资1.32亿元。其中，各级财政资金8847.95万元（通州市财政投入1339.38万元）、单位和群众自筹3853.42万元、专项贷款525.5万元。土地治理项目资金，国家规定从2005年开始全部改为无偿资金投入。

2006年7月1日起，按照中央、省和南通市关于加强对财政补贴资金管理要求，对涉农补贴资金实行“一折通”，财政部门委托农村信用社根据财政部门提供的资金发放清册，将粮食直补、农村低保、农民养老保险、计划生育家庭奖励、革命伤残军人补助、三属抚恤金、村干部报酬、“五保”户供养等财政涉农补贴、补助资金直接打入应得补贴农户的专用存折发放，当年发放13项涉农补贴资金3980万元。至2009年上半年涉农补贴增至28项，主要有粮食直补、综资补贴、油菜补贴、民政“五保”、低保人员补贴、村干部报酬等。2006年7月—2009年6月累计发放涉农资金3.72亿元。