1993年起，通州市金融体制改革力度加大，金融事业得到快速发展。南通银监分局通州办事处、农业发展银行通州市支行、南通市商业银行通州开发区支行、平安保险有限公司通州办事处、太平洋保险有限公司通州办事处、申银万国证券通州服务部、华泰证券通州服务部相继成立。全市农村信用合作社与农业银行通州市支行脱离行政隶属关系。人民保险公司通州支公司、平安保险有限公司通州办事处、太平洋保险有限公司通州办事处实行财产保险与人寿保险分业经营。工商银行通州市支行、农业银行通州市支行、中国银行通州市支行、建设银行通州市支行实现从国有专业银行向国有商业银行转轨。通州的金融业务由原来较为单纯的存、贷、汇等传统业务，演变为传统业务与多功能综合服务并存，银行业务、保险业务、证券业务与担保业务并存，原有业务与金融创新并存的多业并举、共同发展局面。1993—2008年，全市各项存款年均递增19.42%，各项贷款年均递增18.84%；全市财产险保费收入5.57亿元，年均递增8.25%，财产险共理赔3.33亿元；全市人寿保险保费收入28.91亿元，年均递增14.61%，人寿险共理赔5.17亿元。与此同时，建立金融监管机制，严肃金融纪律，清理整顿违规行为，化解金融风险，抑制不良贷款，撤并农村合作基金会。金融业运行平稳，秩序井然，通州成为南通地区唯一的市级金融安全区。