1993年初，境内化肥、农药、农膜等农业生产资料经营以县供销社为主渠道。1993—1997年，市供销社系统围绕“供应及时、数量增加、价格平稳、服务周到”要求，千方百计组织货源，坚持质量标准，维护农民利益。1993年，全系统组织供应各种标准化肥10.69万吨、农药808吨、农膜726吨。市农资总公司、二窎供销社被省供销合作总社、省工商局、省消费者协会联合授予农资商品质量信得过企业称号。1994年，农资市场货源紧张，价格上涨，市供销社系统自行组织化肥2.73万吨，为市化肥厂推销复合肥、碳铵1.5万多吨。1995年筹资500多万元，组织400多人次赴北京、上海、四川、浙江、湖南等省、市，组织计划外尿素1.7万吨、碳铵2万吨、农药50吨。

1998年，国务院规定“化肥由直接管理为主改为间接管理为主”，取消国家统配计划，放开化肥零售渠道和零售价格，农资市场形成多头经营多元化竞争。市农资总公司贯彻落实市政府《关于加强农资市场管理的规定》，建立农资管理小组和打假领导组，组建89人的农资协管员队伍，配合执法部门打击假冒伪劣农资商品，查处农资经营中违规违法行为，平抑市场物价，维护农民利益。全年查处违规经营化肥326.8吨、农药2.9吨、农膜1.76吨，罚没款6.98万元。市农资总公司被省供销合作总社、省工商局、省技术监督局、省物价局评为农资质量价格管理创优质活动优胜单位。1999年，按照市人民政府地产碳铵由供销社总经销的决定，调拨地产碳铵2.7万吨。

2002年，市农资总公司实施“双置换”改革，组建市通联农业生产资料有限公司，下设10个农资销售分公司，实行农资商品“统一采购、统一管理、连锁销售、按销计酬”经营管理体制，全年共销售农资5291万元。2003年6月6日，以市通联农资公司为主体，基层供销社和社会个体加盟为基础，成立市农业生产资料协会，会员43个。

2004年，市通联农资公司和南通和盛农资公司组建农资配送中心，以基层供销社和镇村为农综合服务社为阵地，实施农资连锁经营，实现农资配送到户。2005年，市通联农资公司建办10个配送中心，为150个连锁直销店配供化肥、农药、农膜。南通和盛农资公司在平潮镇建办农资平价大卖场，同时建办4个配送中心，为120个连锁直销店配供化肥、农药、农膜。全年两公司实现农资销售2.55亿元（含外销），在全省同行业县（市）级公司中名列前茅，被商务部批准为“万村千乡”市场工程试点企业。2006年，农资农家店发展到502个，其中通过验收373个，获省“万村千乡”市场工程引导资金273.8万元，占整个南通市资助总额58.75%，在县（市）级居全省第一。全年累计销售化肥17.5万吨、农药1900吨、农膜420吨，实现销售额3.17亿元。通联、和盛农资公司被南通市政府授予“万村千乡”市场工程建设先进单位，通联农资公司被省经贸委授予全省“万村千乡”工程试点先进企业，和盛农资公司董事长李百炎被评为先进个人。2007年，通联、和盛两公司注册18个农资商标，在全省供销社系统首创成立经纪人事务所，专门从事农资、农产品经纪业务和市场信息、技术咨询等服务，78人取得经纪人执业资格。

2008年，全市供销社系统有农资配送中心22个、农资农家店905个。向全市农民组织供应各种标准化肥18.65万吨、农药2540吨、农膜165吨，农资销售额3.25亿元，与1993年相比，化肥、农药销售量分别增加7.96万吨、1732吨，农膜销量减少561吨，农资销售额增加2.37亿元。2009年1—6月，实现农资销售额2.13亿元。