1993年，全市有木材及竹、藤、棕、草制品企业20个，平均从业人数1211人，实现产值6800万元，销售收入4531万元，利税251万元。1997年5月，南通综艺合板有限公司开业投产，主要生产集装箱底板和面背板。1998年9月，市铁木机械厂由于经营管理不善，宣告破产。1999年1月，由江苏综艺股份有限公司和英国金椋木业有限公司共同出资1000万美元，创办南通海林木业有限公司，与南通综艺合板有限公司、综艺东北原木基地等企业，组成江苏综艺集团木业企业群。1999年1月，江苏综艺集团与黑龙江省绥化木材综合加工厂共建林业基地，利用绥化厂的厂房、设备、技术力量，在当地将原木加工成半成品，大幅度降低综艺木业的采购成本，年产半成品材料木12万～15万立方米。

至2008年末，全市有规模以上木材加工及木、竹、藤、棕、草制品企业3个，平均从业人数137人，分布在平潮、兴仁、兴东镇，当年实现产值6910万元，销售收入6886万元，利税1038万元。

1993年，全市有家具制造企业14个，平均从业人数630人，实现产值2462万元，销售收入1701万元，利税84万元。2003年3月，由南通东方家具有限公司和美国路易斯安得森家具有限公司共同出资，兴办东方路易斯家具（通州）有限公司，一期工程投资700万美元，主要产品为中高档家具。2005年3月，总投资6000万美元的家之家具（南通）有限公司在通州骑岸镇工业集中区建成投产。

至2008年末，全市有规模以上家具制造企业3个（其中亿元企业1个），平均从业人数428人，分布在兴仁、刘桥、骑岸镇，当年生产家具1.44万件，实现产值2.26亿元，销售收入2.24亿元，利税3000万元。