1992年，县内有印染企业5个，平均从业人数1884人，产值1.72亿元。1993年3月，由南通八一印染厂、香港德富印染有限公司、江苏南通纺织品联合进出口公司合资兴建南通德富印染有限公司。1997年，川港毛纺织总厂以实现产值1.8亿元，创利税1817万元的实绩，进入全国最高利税1000家乡镇企业第896位。1999年，金鼎集团投入500万元，购进绳状漂染线、液流染色机、大卷装染色机、平网印花机、圆网印花机等，形成两条平网印花、一条圆网印花生产线，日印花3万多米，是年实现利税500多万元，跨入市百强企业、明星企业行列。2002年，先锋染织公司投入1400万元进行筒子染色、丝光整理等改造，成为南通色织行业龙头企业，是年实现销售1亿元，利润258万元。2003年5月，由香港永逸发展有限公司与南通金红印花有限公司合资建办的通州金红化纤印染有限公司开工，一期工程投资500万美元，生产高档印花布。二甲镇生产蓝印花布已有数百年历史，有生产企业20多个，其中正兴染坊保持传统的“小青缸”染色法，产品色泽纯真、色牢度稳定。2006年5月，南通蓝印花布被列入国家首批非物质文化遗产名录。2007年3月，中国纺织工业协会在北京举行第六批全国部分纺织产业集群试点地区会议，通州市先锋镇被命名为“中国色织名镇”。

至2008年末，全市有规模以上印染企业19个，其中亿元企业2个。主要分布在金沙、二甲、四安、兴仁、东社、川姜、张芝山、先锋等镇和开发区，平均从业人数2006人，当年实现产值9.87亿元，销售收入9.83亿元，利税1.15亿元。