1993年后，在市农业局和多种经营管理局的领导下，以市农业技术推广中心、多种经营技术推广中心为中枢，区和乡镇农技站与多种经营指导站为基础，村专职农技员为补充组成农技推广网络，承担农业技术试验、示范、推广、培训任务。1996年3月，区级机构撤销后，原区农技站人员分别安排到有关乡镇农技站。1998年乡镇机构改革，原属市农业局、多种经营管理局管理的乡镇农技站、多种经营指导站、能源站都划归各乡镇管理，市农业主管部门变为协管部门，对乡镇农技站和多种经营指导站只负责业务指导，人员、工资关系全部脱钩。1999年后，部分乡镇因财政困难，农技人员工资福利得不到保证，不少农技站处于自己“找饭吃”的“断奶”状态；同时，经过调整行政村、小村并大村，精减村级脱产人员，多数村取消了专职农技员，有的由村委会主任兼任，农技推广网络一度出现“线断网破”的现象。2001年11月，市委办公室、市政府办公室印发《通州市镇机构改革实施意见》，明确镇农业技术服务站为镇属事业单位。2003年7月，市农林技术推广中心所属各专业站（所）定编定员竞争上岗。2004年，各镇农业服务机构进行多专业整合，分别组建成镇农业服务中心。至2005年末，市、镇两级农技推广体制改革全面完成。2006年开始实施园艺业科技入户工程，创新农技推广服务机制。

2008年11月5日，通州市农林局在全省率先设立富民大厅，组织作栽、植保、水产、林果、畜牧等专业的专家轮流值班，24小时开通三农服务热线，为农民提供农业新品种、新技术、扶持新政策咨询，农产品市场供求信息发布，并且不定期巡回到镇村田间地头为农业生产服务，随时解决广大农民在生产中遇到的技术难题。《江苏科技报》《南通日报》等平面媒体和多家网站分别进行专题报道。2009年4月1日，中共南通市委学习实践活动指导检查组参观富民大厅后，对这一亲民务实创新举措给予充分肯定。