1994年，经南通市政府批准，由通州港区组织实施，对东方红农场南侧、涵洞以东江滩进行围垦，当年12月动工，次年12月竣工。共投资500万元，由市沿江沿海开发指挥部与江苏省沿海开发利用管理局对等投资。工程实施后，增加土地1000亩，可用长江岸线1650米。1999—2000年，新围堤列入主江堤达标建设。2001年，南通正大农药厂从金沙搬迁至此。

1996年初，对开沙西南角（开沙涵洞至如皋长青沙界）的滩地进行围垦。围堤长1380米，围得土地500亩。初围标准低，当年受8号台风和高潮位侵袭而破圩，下半年复围。1997年受11号台风袭击又破圩，灾后再行修复，并提高了标准，建了混凝土护坡，使围堤得以稳定。初围和复围，市国税局先后投资500多万元。围成后，用于种植名贵树木，养殖观赏鱼类，建设休闲农业基地。

经交通部长江港航监督局和水利部长江水利委员会及南通市政府批准，对东方红农场西南侧江滩进行围垦。由通州港区组织实施。于1996年4月动工，次年11月竣工。围垦前，韩国株式会社水山重工独资兴办的水山造船（通州）有限公司就与通州港区达成意向，于新围地内建造船厂、新围地外建码头，围垦所需投资3099万元，水山公司出资62.8%，中方出资37.2%。围成后共增加土地1100亩，可用岸线1450米。1999—2000年，新围堤列入主江堤达标建设。

经南通市政府批准，李港乡组织对通西弯耳圩江滩实施围垦。1997年1月动工，当年汛前完工。围堤长1044米，造田220亩，共投资228万元，其中李港乡政府投资7万元，李港砖瓦厂投资208万元，南通市政府补助13万元。围成后，先由李港砖瓦厂用于堆放南通华能电厂输送来的煤灰。2003年7月，韩通船舶机械设备（通州）有限公司支付围垦补偿费270万元，于当年12月办理土地使用权变更手续，建成两座5万吨级船台、1座5万吨级多用途码头的修造船厂。

通海张芝山二号滩老圩堤堤线内弯，堤外经多年淤涨形成较大滩面。经省水利厅和南通市水利局认可，在老圩堤外取直筑新堤1040米。于1999年3月动工，5月完工。在土方工程完工后即建造灌砌石护坡，2001年又实施二号滩涵洞新建工程。土方、护坡、建涵洞等共投资400多万元，从江海堤防达标专项资金中列支。新堤围成后增加土地150多亩，有1000多米的岸线紧邻苏通大桥，具有珍贵的开发利用价值。同期同样经费渠道，在新开闸至洪港水厂段老堤外筑新堤980米，土方工程投资170万元，建护坡和砌石棱体250万元，围得土地100多亩。新堤围成后由于长江河势变化，堤外出现深泓，经南通市水利局同意，投资53万元，进行沉排抛石处理，稳定新围堤防。

20世纪70年代以后，开沙与长江北岸之间逐渐隆起一片沙洲，当地人称为“里沙”。21世纪初，这片沙洲平均高程已达2.4米以上。该段江面宽阔，将其匡围，对长江行洪和天生港水道影响不大。2001年，五接镇自发对华沙大桥以西的沙洲进行初围，围堤长1600米，筑中埂800多米，围得土地800多亩。2002年又对初围堤加大培厚。围成后，在靠近开沙老堤处建办经营餐饮与垂钓的秀岛山庄。2003年再对华沙大桥以东的沙洲进行围垦，围堤长2180米，围得土地1400亩。两次围垦的围堤相连共长3780米。围堤土方工程投资350万元，其中市国土局垫支100万元，五接镇通过多方筹资投入250万元。围堤未建护坡，堤顶高程、宽度、坡比均未达标，也未经台风、高潮位、大洪水考验。2007—2008年，对“里沙”东西段长2306米的堤防加高培厚，使堤身达到顶高7.25米，顶宽6米，迎水坡1∶3、背水坡1∶2.5；在新建的两座引排涵洞沿洞身两侧各50米建块石护坡，洞身外抛石护坎。共投资161万元，完成土方8.4万立方米。

1993—1996年，海晏乡、海洋渔业总公司等沿海地区的干部群众集资筹款，组建26个滩涂养殖场，围网护养，以青蛤为主，养殖面积3万多亩。

1997年，组建通州沿海滩涂开发园区，由海晏乡政府承办，建养殖场52家，参加养殖的700多户，养殖面积1.2万亩，当年养殖产值4500万元。1999年3月，扩建通州沿海滩涂开发园区，利用世界银行贷款15.5万美元，建成年产40亿粒泥蚶、青蛤苗的育苗场和全省最大的青蛤人工养殖基地，滩涂开发园区面积扩大到2万亩，并在通州、如东、海门三县（市）交界沿海滩涂共管区域内投资1500万元，开发养殖面积2.5万亩，当年产贝3000吨，产值6000万元。

1999年，市农业资源开发局自筹资金170万元，在团结闸出海港南侧开发高潮区滩涂1000亩，建成特种水产育苗场，实施青蟹、青蛤、文蛤、缢蛏等贝类混养，当年获利23万元，至2002年已收回全部投资。

2008年，全市近海滩涂贝类养殖面积已达6.56万亩，产量1.29万吨。

2008年2月，开始实施通东海洋滩涂围垦。先围南区，匡围南起团结闸北支堤，北至纳潮涵洞南150米，围堤全长7667米，匡围面积9410亩，起围高程0.2米，围堤顶高程8.4米，顶宽8米，完成土方180万立方米，工程总投资4100万元，于当年11月15日完工。2009年4月至6月，实施垦区内吹填土工程，工程总投资4900万元，吹土区设计高程3.0米，吹填土方395万立方米，完成吹填面积4300亩。