1992年末，境内公路总里程443.33公里，其中，国道17.12公里、省道83.94公里、县道250.47公里、乡道88.25公里，通往兴东机场专用公路3.55公里。1993年通州设市后，公路发展速度加快。1996年，农村公路基本实现路面黑色化。1998年开始建高速公路。2003年启动农村公路建设新一轮规划。2008年，农村公路步入建管养一体化轨道。2009年初，市政府将农村公路建设列入全市28项民生工程之一。至2009年6月底，全市公路总里程2349.47公里，公路密度173.84公里/百平方公里、18.91公里/万人。按公路网地位分：国道（含高速公路）76.03公里、省道131.47公里、县道372公里、乡道902.1公里、村道867.87公里；按公路技术等级分：高速公路64.14公里、一级公路77.16公里、二级公路337.36公里、三级公路208.36公里、四级公路1560.49公里、等外公路101.96公里；按路面等级分，高级路面（沥青混凝土或水泥混凝土路面）2243.6公里、次高级路面（沥青表处路面）39.03公里、中级以下路面（砂石路面）66.84公里。

宁通高速公路及九华互通立交工程  宁通高速公路的前身宁通一级公路，1993年备土，1996年11月建成通车。1998年12月，宁通公路高速化工程动工，2000年11月，九华立交续建工程和宁通一级公路全封闭高速完善工程竣工，并正式开通，实现通州交通建设史上公路互通立交零的突破。宁通高速公路西起南京绕城公路雍六互通，东至通州市平潮镇区，全长214公里。通州段西起平潮镇颜港村，东至九圩港村，途经五接镇，长8.57公里。九华互通立交工程位于宁通公路通州市五接、平潮镇和如皋市九华镇境内，是宁连、宁通高速公路8座互通立交中最大的一座，投资1.4亿元。该工程占地27.6公顷，其中，通州境内占地10.3公顷。

G40沪陕高速通州段  西起宁通公路九华立交，经平潮、平东、兴仁、兴东、先锋、张芝山镇，东至川姜镇与海门市交界处，长36.39公里，沥青路面，宽23～27米。2001年7月28日奠基开工，2004年10月30日建成通车。

G15沈海高速通州段  北起刘桥镇尹家园村与如皋市交界处，向南经四安镇至兴仁镇葛长路村与沪陕高速交会，长19.18公里，沥青路面，宽30.5米，2002年开工建设，2005年11月1日建成通车。

G204通州段  北起平潮镇颜港村，南至九圩港村，始建于20世纪50年代。1998年改线、改造，公路里程由17.12公里缩短为12.66公里，路面宽度由9米拓宽到12米。2001年公路普查，确认里程11.89公里。2002年建成部级文明样板路。

2007年5月28日，启动204国道改线段工程建设，西起通州与如皋交界处，途经平潮、平东镇，向东南至南通陈桥，长8.05公里，路面宽26～28米，至2009年6月底仍在建。

S223（原通掘公路即S203线部分路段和南延段）  如东至通常汽渡。通州段途经十总、五甲、东社、金沙、川姜、张芝山六镇，长41.9公里，沥青路面宽14～26米。始建于1957年。2000年4月10日，苏203线拓宽改造工程（通如桥至S335线路口段）开工，12月21日建成通车，总投资8000万元。公路用地宽33～40米，通州城区和十总镇区路段按城市道路“三块板”设置，快车道15米，路基顶宽28米，设计行车时速60公里；其余路段按一级公路标准设计，双向4车道，路基宽度25.5米，路面宽度22.5米。2001年，S223省道线路调整，将通掘公路九华山转盘到南通段改为S335省道。3月21日，S203线南延新建工程正式启动，北起S335线连接金石线（原石江公路），南接南兴线乡道，全长21.33公里，按一级公路标准规划，二级公路标准建设，路基宽17米，路面宽14米，路桥同宽，道路用地宽度28米，2002年10月18日建成通车，总投资1.19亿元。2003年4月，投资1056万元完成控制区15米内公路绿化工程。2006年4月，启动S223省道南兴至通常汽渡段（北起南兴线，南至与南通开发区交界的中心河桥，与沿江公路连接）改造工程，2007年9月竣工，2008年1月29日交付验收。工程按一级公路标准建设，路基顶宽26米，路面宽24.5米，长1.81公里，双向四车道，总投资2826万元。

S335（原S318线和原S203线部分路段）  吕四至南通，始建于20世纪50年代。通州境内途经东社、二甲、金沙、兴东、兴仁五镇，全长26.46公里。1993年2月开始实施金通公路拓宽改造工程，按一级公路标准设计、施工，全程为沥青路面，路宽60米，中间快车道宽25米，设6车道，两侧为慢车道。1996年9月1日通车，同年设金通公路通州收费站。1998年，S335省道首次拓宽改造，完成路基、路面和油封工程。2001年启动二次拓宽，由三级公路升为一级公路，路面宽24米，全长14.21公里，沿线5座桥梁全部改建。至2003年8月完成，并通过省级文明样板路创建验收。原S203线的九华山转盘至南通段12.25公里调整为S335线，2003年完成路面改造工程。2008年，S335省道通州段（通常称金通公路）实施功能提升工程，东起223线东延路口，西至通州与南通交界处，全长18.6公里，投资1.8亿元，公路用地60米宽，双向6车道，公路用地红线外15米为拆迁范围，绿化一般地段每侧宽20米，城区段东大市场至九华山转盘绿化宽度每侧30米。同时，东大市场、兴东、兴仁路口等9个接点设景点造型。

S222（掘青公路即原S202线）  如东至青龙港，始建于1960年。通州段全长11.91公里，全在三余镇境内。2002年10月实施改造，全线由三、四级道路改为二级公路，改造里程11.77公里，其中，老路拓宽改造5.44公里，新建公路6.33公里和桥梁3座。公路用地宽24～28米，路基宽12～17米，沥青路面宽9～12米，改造工程总投资2700万元。

S225（原岔兴公路）  如东小洋口至南通。通州段途经石港、四安、兴仁三镇，始建于1982年，2001年升为省道。2004年由四级公路改造为二级公路，改造总里程23.15公里，公路用地宽28米（镇区宽31米），路基顶宽17米，沥青路面宽14米（镇区宽23米），桥梁全部新建，九圩港大桥至阚庵桥段局部改线，其余均由老路改造，工程总投资1.18亿元。

S325（寅通公路）  启东寅阳至南通。通州段始建于1958年，途经川港、张芝山、小海三镇。1998年完成17.51公里路基、路面和油封改造工程。1999年9月，投资3200万元拓宽改造。2001年，小海镇划归南通市区后，境内长9.58公里。同年调整为县道。

S336（S325新线）  启东圆陀角至江都。1999年5月开工新建，通州段经竹行、张芝山、川港一乡二镇，长11.62公里，公路用地宽42.8米，路基顶宽25.5米，中央分隔带宽2米，双向4车道，水泥混凝土路面。2000年9月30日建成通车，总投资1.09亿元。2001年3月，竹行镇划归南通开发区后，通州段缩短至8.3公里。

S221（海防公路）  海安至启东。通州段途经环本农场、三余镇东部，长17.94公里。2001年8月开工新建。线路走向基本沿用原第二道海堤，按二级公路标准建设，路基宽12米、面宽9米，用地宽24米。新建桥梁4座、箱涵3座，设计荷载标准汽-20、挂-100。2003年7月4日建成，总投资5180万元。

1992年开始实施农村公路路面黑色化（砂石路面改造成沥青路面）工程，至1996年基本完成。嗣后，为提高通州农村公路网络化格局，市政府决定用3～4年时间进行乡村公路改造，实现全市村村通公路，并要求乡村公路按国家等级公路标准规划实施。至2002年，共完成砂石公路黑色化工程和混凝土路面改造340公里。2003年下半年，启动农村公路建设新一轮规划，至2008年末，全市共有农村公路2141.97公里，其中，县道（市通镇公路）372公里、乡道（镇通镇公路）902.1公里、村道（镇通村公路）867.87公里。2009年初，市政府将农村公路建设工程列入当年28项民生工程之一，计划投资4亿元，规划建设农村公路1000公里（包括省计划126.44公里），力求覆盖全市所有镇、区，基本形成镇、村、组联通的镇村公路骨架网路。