由于地理和气候因素，通州市台风、暴雨、冰雹、龙卷风等自然灾害频繁发生。1993—2008年，几乎每年都会受到一种或几种自然灾害的侵袭。16年中，按灾害发生的种类划分：遭暴雨、冰雹、龙卷风“三害”齐袭的1个年份（1993年），遭台风袭击造成重大灾害的1个年份（1997年11号台风），受台风外围影响的7个年份（1996年8号台风，2000年12、14号台风，2001年2、8号台风，2002年5号台风，2004年7号台风，2006年5号台风，2007年13号台风），旱灾2个年份（1994、2005年），遇雪暴、强寒潮2个年份（1998、2008年），旱涝急转、强降雨造成时段性灾害的3个年份（1995、1999、2003年）；按损失大小和受灾面积划分：重灾3个年份（1993、1996、1997年），一般性灾害10个年份，风调雨顺、基本无灾的3个年份（2001、2003、2006年）。16年中，灾害造成直接经济损失6.45亿元，年均受灾农田面积3万公顷；共伤亡609人，其中死亡20人，重伤86人，轻伤503人；先后倒塌房屋7390间，损坏2.62万间。面对各种自然灾害，市委、市政府高度重视，坚持防汛防旱两手抓，立足于抗大灾、抗多灾，完善防汛抗旱应急预案、城市防洪预案，重点镇完成防洪排涝预案，并且分地区组织防汛演练，提高防汛防旱指挥部及责任单位人员防汛抗台应急处置能力。每年5月都要召开全市防汛防旱工作会议，预测分析当年灾情，作出防汛防旱工作部署。汛前，市党政领导都要视察江海堤防，查勘险工险段，指定责任单位和部门及时采取措施，消除隐患。接到灾情预报，立即通过电视、广播、传真等途径，以最快速度予以通报，提出明确要求，动员干部群众投入防灾抗灾。在灾害来临前，市四套班子领导分工负责，赶赴抗灾一线组织指挥。由于领导重视，预防和抗灾措施得力，16年中未出现主江堤和海堤决口，未发生海水倒灌灾难。虽然年年有灾，有的年份灾害特别严重，而灾害的影响和损失都能减少到最低限度，未出现农作物大面积绝收、民众饥慌、企业长时间停工停产的局面。特别是实施江海堤防达标工程建设以后，全市防洪保安能力大大提升，因台风和旱涝灾害造成的损失明显减轻。