通州市境内水利工程设施大多建于20世纪50—70年代，限于当时经济和技术条件，一般设计标准低，在多年运行以后，原有功能逐渐下降。从1993年起，市政府根据经济社会发展对水利提出的新要求，从实际出发，认真调查研究，科学规划，统筹安排，组织和调动必要的人力、物力和财力，实行水安全、水资源、水环境综合治理。按照规定标准，对江海堤防全面维修加固，改建和新建16座穿堤涵闸、3座内河水系控制涵闸，进一步提高防洪挡潮和引排调节能力，成功地抵御了台风、洪潮、雨涝、干旱等自然灾害。同时，有计划地进行以疏浚整治县乡河道、推广节水灌溉、改造中低产田为主要内容的农田水利建设；开展水法规宣传，严格水事执法，改革水利管理体制，注重水资源保护和科学有序的开采利用，加强水利工程设施管理，从而逐步由以引排为主的传统型水利向科学开发利用水资源、优化水环境、保障水安全、实现人水和谐的现代型水利转变。1998年12月，市水利局被人事部、水利部表彰为1998年抗洪抢险全国水利系统先进集体；2005年12月，被人事部、水利部表彰为全国水利系统先进集体；2006年10月，被水利部表彰为全国水利建设与管理先进集体。