土类分布  境内农田土壤的成土母质，绝大部分是长江从上游带来的泥沙和沿海洋流搬来的泥沙，由于成土时间、气候因素和人类活动等不同成土条件的影响，形成了多种土壤类型，有潮土、盐土、水稻土三大土类。潮土为灰潮土亚类，其中以夹沙土为主；盐土为滨海盐土亚类，其中以壤性脱盐土为主；水稻土为渗育型水稻土亚类，其中以夹缠土和黄粘土为主。各类土壤分布如下：

潮土主要集中在中部、西部和西北部，面积4.1万公顷，占全市耕地面积的55.74%。潮土区土壤的属、种较多：夹沙土属占潮土面积的70%，为生产性能较好的土壤类型，黄泥土属占12.4%，还有分布于平潮西部的高沙土。潮土类土体中富含碳酸钙，1米土体平均含量3.08%；酸碱度一般在7.5～8.5之间，属中性到弱碱性。0～20厘米土壤容重平均每立方厘米1.27～1.42克。

盐土主要分布在范公堤以东的海积平原，其西缘在纱场—唐洪—二窎一线，面积2.3万公顷，占全市耕地面积的31.26%。滨海盐土亚类有沙性、壤性、粘性土属之分；每个土属根据其1米土体土壤含盐量高低，又分脱盐土、轻度盐土、中度盐土3个土种。一般距海愈近，成土年龄愈轻，土体含盐量愈高。盐土含盐量和地下水的矿化度，由西向东逐渐增加。0～20厘米土壤容重平均每立方厘米1.36克，酸碱度8左右。盐土中，壤性脱盐土比重最大，计1.24万公顷，占盐土面积的53.99%，改良潜力大，可由中等田改良为上等田。

水稻土主要分布于北部的水网平原，面积9559公顷，占全市耕地面积的13%。土壤质地偏粘，0～20厘米土壤容重平均每立方厘米1.41克，酸碱度属中性到微碱性，耕作层厚度小于12厘米的占36%。境内渗育型水稻土又分为夹缠土属和黄粘土属，夹缠土属有7558公顷，占水稻土面积的79.07%，其耕作层养分含量高，为市内最肥沃的土壤。

养分含量  通州市耕作层土壤质地大部分为轻壤级，约占总耕地面积的68.2%；其次为砂壤级和中壤级，分别占总耕地面积的16.05%和13.95%，这3种土壤是农业土壤中理想和比较理想的土壤表层质地。其余1.8%耕地面积的土壤为质地较差的重壤和沙土。

20世纪80年代以后，通过改革耕作制度，实行合理轮作，适当减少复种指数，推广秸秆还田，不断提高土壤肥力。据2001年市农业部门组织的第三次土壤肥力调查，全市土壤中几种主要养分含量：有机质16.2克/公斤，全氮1.21克/公斤，速效磷7.6毫克/公斤，速效钾91.6毫克/公斤，有效锰162.3毫克/公斤，大部分接近或超过历史最好水平。

自然植被  绝大部分自然植被为湿生和水生植被，广泛分布在河沟、池塘的水面及河滩、河岸上，主要有芦苇、菖蒲、荻、蒲草、茅草以及各种杂草。20世纪60—70年代，水浮莲、水花生、水葫芦和绿萍等，曾被当作绿肥和饲料作物在内河放养，兴起于一时，逐渐形成大面积的水生植被。由于过度放养，不能充分利用，以致造成水体污染，不少地方已经加以清除。据市植保站调查，市内常见的农田杂草有440余种。盐生植被分布在滨海地区，有盐蒿、茵陈蒿、芦竹等。

人工植被  陆生植被多为人工植被，其中：（1）薪材植被。20世纪70年代开始形成的保土护堤、防沙防风的防护林，品种有刺槐、苦楝、旱柳、白榆、枫、杨等。江海堤岸下有成片的芦苇。竹园大多分布在通甲公路以南一线，品种以毛竹、篾竹为主。内河两岸多湖桑园，以及其他一些经济林木。（2）风景园林植被。农户在房前屋后栽植的有水杉、侧柏、池杉、洋槐、枫杨等；街道两边栽植的有银杏、香樟、梧桐、夹竹桃、冬青、卫矛、楝树、龙柏、雪松等；庭院观赏植物有棕榈、美人蕉、月季、绣球、桂花、天竹、广玉兰、菊花等；山茶、杜鹃、铁树、罗汉松、雀舌等多制作盆景观赏。果园发展也较快，品种既有温带的柿、梨、桃、李、杏、葡萄，也有亚热带的枇杷、柑桔等。落叶乔木银杏，1997年1月7日经通州市人大第26次会议确定为市树，境内有500年树龄者近10株。（3）农田植被。市内种植的主要农作物，秋冬季有小麦、大麦、元麦、蚕豆、油菜等，春夏季有水稻、棉花、玉米、大豆等，在通海地区还有薄荷、红麻、黄麻、中药材等特种经济作物。蔬菜栽培四时不断，除在田间种植外，还有茭白、菱、藕、水芹、慈姑等水生植物。

20世纪80年代以后，在政府“绿化祖国”的号召下，广大干部群众积极植树绿化，美化家园，全市植被覆盖率不断上升。1993年1月，经国家林业局审定，森林覆盖率为10.8%，被授予全国平原绿化先进单位称号。2008年，森林覆盖率已达到20.05%。2009年1月，再获江苏省绿化造林先进县（市）称号。